[최신연구동향] (Science) 인류가계도(3609개 유전체 샘플 확보, 2695만명 유전체 연결)
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2022.04.23 12:43
[10만년전 조상부터 현생 인류까지 잇는 역대 최대 규모의 '인류 족보' 나왔다]
3,609개 유전체 샘플 확보 2,695만명 유전체 연결
고대와 현대의 인류 유전체 정보를 기반으로 시간과 공간에 따라 추론한 인류 가계도를 시각화했다.
각각의 선은 부모와 자손 간의 관계를, 선의 굵기는 이런 관계를 관찰한 횟수를 나타낸다.
선의 색깔에 따라 관계를 관찰한 연도도 나눴다. (영국 옥스퍼드대 제공)
역대 최대 규모의 인류 유전체 족보가 나왔다. 지금까지 개별 데이터로 축적된 약 10만년 전 고 대 인류부터 현생 인류까지 3609개의 인간 유전체 샘플을 가계도로 구성해 약 2695만명에 달 하는 인류의 단일 유전체 족보를 만들어낸 것이다.
인류 족보 완성본에 가깝다는 평가를 듣는 이번 인류 가계도를 통해 현생 인류가 아프리카에서 기원해 총 2억 4563만 1834회의 유전적 변이를 거쳤다는 사실이 확인됐다.
길 맥빈 영국 옥스퍼드대 빅데이터연구소장 겸 통계유전학과 교수팀은 “인류 모두의 조상을 추 적하는 중요 단계를 밟았다”며 연구결과를 국제학술지 '사이언스'에 24일(현지시간) 공개했다.
연구결과는 인류 진화 역사에 대한 이해는 물론 전세계 개개인이 서로 어떻게 유전적으로 연결 돼 있는지 밝히고 개인 맞춤형 질병 원인과 치료법을 찾는 데도 도움이 될 것으로 기대된다.
지난 30년간 축적된 인간 유전체 연구를 한데 모았으며, 개인맞춤형 '정밀의학'에 도움이 되기는 물론 다른 생물 유전체 가계도에도 적용이 가능한 기술로 집단 유전학자인 정충원 서울대 생명과학부 교수는 "현재 수준에서 가장 완벽한 유전체 정보에 가까운", "상당히 혁신적인 유전학 분석기술"이라고 말했다.
○ 지난 30년간 축적된 인간 유전체 연구 한데 모았다
생물은 수 많은 세포로 이뤄져 있다. 세포핵의 염색체에는 유전정보를 담은 DNA가 들어있다. DNA는 약 30억 개의 염기로 구성돼 있는데 염기의 배열순서에 따라 생명 활동에 필요한 단백질이 만들어진다. 유전체는 DNA에 포함된 30억 개 염기의 배열순서(염기서열) 전체를 밝힌 것이다.
유전체는 신종 코로나바이러스감염증(코로나19) 바이러스처럼 시간이 지남에 따라 유전적 변이를 겪는다. 세대를 거듭하며 후손에게 전달된 유전체가 사람마다 조금씩 차이를 보이는 이유다. 나무가 하나의 뿌리에서 여러 형태의 가지로 뻗어가며 자라는 것과 유사하다.
과학자들은 이런 점에 착안해 유전체 분석을 통해 인류의 뿌리를 알아내려 시도하고 있다. 뿌리 뿐 아니라 지역별 혹은 시대별 유전체 분석을 통해 과거의 변화도 파악할 수 있다. 가령 아메리카 대륙을 처음 밟은 인류는 누구인지 등과 같은 역사적 난제를 풀 수 있는 단초가 된다. 1990년 시작된 인간유전체 프로젝트(휴먼게놈) 등 지난 30년간 인간 유전체 연구가 활발해지며 관련 샘플도 충분히 확보됐다. 이번 연구에도 215개 종족 총 3609개의 인간 유전체 샘플이 포함됐다. 이 샘플들에서 확인된 유전적 변이만 641만 2717회에 달한다.
문제는 각기 다른 데이터베이스에 축적된 엄청난 양의 인간 유전체 연구 데이터들을 한데 묶고 처리하는 것이었다. 서로 다른 유전체 샘플 채취법이나 분석법, 고르지 않은 품질 등을 해결하는 것도 난제였다.
연구팀은 알고리즘을 개발하고 이같은 문제를 해결했다. 존재했던 모든 인류가 하나의 가계도로 이어질 수 있다는 가설만을 토대로 유사한 변이를 보이는 유전체를 연결짓는 알고리즘이다.가계도 상 비어 있는 연결고리는 추론을 통해 잇고 데이터에 입력된 위치정보를 활용해 조상들이 언제 어디서 살았는지 추정할 수 있다.
연구팀은 전 세계 인간 유전체 데이터베이스 8곳에 축적된 데이터와 자체 개발한 알고리즘을 적용한 인류 가계도를 그렸다. 그 결과 8개 집안으로 흩어져 있던 2695만명의 인류가 한 집안을 이뤘다. 이들은 총 2억 4563만 1834회의 변이를 겪었지만 유전적 연결성을 가진 것으로 분석됐다. 특히 유전적 특징의 시간적, 지리적 변화를 분석한 결과 인류가 아프리카에서 등장한 것을 포함해 유라시아로 이동 후 오세아니아 등 전 세계로 퍼진 점 등 인류 진화 역사의 주요 사건들도 재현해냈다. 연구팀은 “유전체 데이터 품질이 점점 향상되고 있다”며 “현생 인류 개개인의 유전적 연관성을 밝히는 가계도도 만들 수 있을 것으로 보인다”고 전망했다.
○ 개인맞춤형 '정밀의학'에도 도움... 다른 생물 유전체 가계도에도 적용
인류의 가계도는 의학 연구에도 활용이 가능할 것으로 기대된다. 특정 질병이 있는 환자의 유전체와 비교해 염기서열이 어떻게 다른지 알아낼 수 있다. 염기서열이 달라져 변이가 생긴 단백질을 밝혀내 질병의 원인이나 약물 효능 등을 따지는 것이다. 개인 맞춤형 치료법을 제시하는 이른바 ‘정밀의학’도 유전체 분석이 밑바탕이다. 연구팀은 유전체 데이터를 추가 확보해 가계도에 지속 반영할 계획이다.
연구팀은 개발한 알고리즘은 인간 외 다른 생물에도 적용이 가능하다. 연구팀은 “박테리아부터 오랑우탄까지 모두 적용 가능하다”며 “진화의 역사를 명확히 할 수 있을 것”이라고 했다. 집단유전학자인 정충원 서울대 생명과학부 교수는 “현재 수준에서 가장 완벽한 유전체 정보에 가깝다”며 "상당히 혁신적인 유전학 분석기술"이라고 말했다.
* 주요 출처
- (기사) (동아사이언스) https://m.dongascience.com/news.php?idx=52559
- (논문) Science, A unified genealogy of modern and ancient genomes, 2022.2.25
